L&B Genomics

L&B Genomics

LIFE & BRAIN Genomics ist einer der führenden europäischen Serviceanbieter für arraybasierte omics-Analysen. Wir unterstützen unsere Kunden aus Wissenschaft, Gesundheitswesen und Industrie mit innovativen Produkten und wissenschaftlichem Know-how von der Projektplanung bis hin zur Datenanalyse.

Durch die enge Anbindung an das Institut für Humangenetik in Bonn steht LIFE & BRAIN Genomics in ständigem Austausch mit der Forschungsgemeinschaft und entwickelt kontinuierlich neue Anwendungen für die Generierung und die Interpretation von „omics“ –Daten. Dies spiegelt sich auch in den exzellenten Track records unserer Mitarbeiter auf diesem Feld wieder.

Unsere Services umfassen die folgenden Bereiche:

Biobanking

Eine strukturierte Probenverwaltung und optimale Biobanking-Bedingungen bilden die Grundlage für erfolgreiche Analysen.

Dazu zählen bestmögliche Lagerbedingungen für verschiedene Biomaterialen, standardisierte Extraktionsmethoden, eine umfassende Qualitätskontrolle und Dokumentation sowie die Vorbereitung von Arbeitslösungen für die geplanten Analysen.

L&B Genomics verfügt über verschiedene Robotiksysteme zur Probenvorbereitung.

Die Lagerung der Proben erfolgt in 2D Matrix Röhrchen und Barcode-markierten Racks. Dabei ermöglicht die Probenkodierung über unseren hausinternen Unique Sample Identifier (USI) eine genaue Nachverfolgung Ihrer Proben im Labor.

Unsere Gefrierschränke und Stickstofftanks sind mit Temperaturüberwachungssystemen ausgestattet und ermöglichen somit eine sichere Langzeitlagerung von Biomaterialien.

Unsere Biobanking-Services umfassen:

  • Lagerung von Biomaterialen (Blut, DNA, RNA, Serum, etc.)
  • Automatisierte Nukleinsäure-Extraktion
  • DNA/RNA Konzentrationsmessung und Normalisierung
  • Reformattierung von Lagerformaten (Einzeltubes in Plattenformat, 96well in 384 well Format)

Die DNA oder RNA-Isolation ist der Startpunkt für die meisten Omics-Analysen.

Wie verfügen über Extraktionsroboter, die eine standardisierte Extraktion hochmolekularer DNA und hochqualitativer RNA aus einer Vielzahl verschiedener Biomaterialien (s.u.) ermöglichen.

Dabei verlassen wir uns auf unsere langjährige Expertise in der Etablierung und Anwendung verschiedenster Extraktionsprotokolle, die wir auch gerne bei der Optimierung der Extraktionsmethoden für Ihr spezifisches Projekt einbringen.

Gerne beraten wir Sie auch bei der Auswahl des geeigneten Sammelsystems, um eine optimale Qualität Ihrer Samples sicherzustellen.

Wir bieten DNA-Extraktion aus

  • Vollblut (frisch oder gefroren)
  • Buffycoat
  • Speichel
  • Gewebe
  • Zellpellets

Wir bieten RNA-Extraktion aus

  • PAXgene Blutproben
  • Gewebe
  • Zellpellets

Standardmäßig prüfen wir alle extrahierten Nukleinsäuren photometisch bezüglich Qualität und Quantität.

Darüber hinaus können wir Ihnen folgende Services anbieten:

  • DNA-Konzentrationsmessung mittels PicoGreen
  • RNA-Konzentrationsmessung mittels QuantIT
  • Qualitätsprüfung mittels BioAnalyzer
  • Normalisierung auf bestimmte Konzentration
  • Aliquotierung der Proben
  • Biobanking

L&B Genomics bietet ein breites Spektrum an Genotypisierungsmöglichkeiten von einzelnen Varianten bis zu hin zur genomweiten Analyse.

Dabei beraten wir Sie gerne in der Auswahl der geeigneten Plattform für Ihre Fragestellung.

Als Illumina Propel zertifizierter Serviceprovider haben wir langjährige Erfahrung in der Generierung qualitativ hochwertiger Arraydaten.

Seit 2016 ist L&B Genomics leitendes Mitglied im European Global Screening Array Consortium.

Unsere Genotypisierungsservices umfassen:

  • Genomweite arraybasiete Genotypisierung mittels Illumina BeadArrays
  • Genotypsierung einzelner Varianten (SNPs, CNVs) mittels Real-Time PCR
  • Analyse von Sets von Varianten mittels Agena Bioscience iPLEX®
  • Molekulare Karyotypisierung

Die Analyse epigenetischer Mechanismen gewinnt zunehmend an Bedeutung.

L&B Genomics bietet aktuellste Techniken zur Analyse von DNA-Methylierungsmustern an.

Gerne beraten wir Sie bereits in der Planungsphase bezüglich Design, Probenvorbereitung und Qualitätskontrolle ihrer Proben, um optimale Untersuchungsergebnisse erzielen zu können.

Unsere Services umfassen:

  • Genomweite Analyse mittel Illumina Methylation Array
  • Analyse ausgewählter CpG-sites oder Promoterregionen mittels Agena Bioscience’s MassaARRAY® EpiTYPER assay®

L&B Genomics ist einer der wenigen europäischen Serviceprovider für 3rd Generation Sequencing Analysen mittels PacBio Sequel Technologie.

Das Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing eignet sich für eine Vielzahl von Applikationen und ermöglicht mit Leselängen von >20kb umfassende Einblicke in das gesamte Spektrum genetischer Variabilität (inklusive struktureller Varianten) und sowie Allelspezfisches Haplotype-Phasing.

Die Qualität und das Molekulargewicht der Ausgangsproben haben einen entscheidenden Einfluss auf den Erfolg des Experiments. Wir beraten und unterstützen gerne bei der Auswahl der passenden Extraktionsmethode.

Derzeit etablieren und entwickeln wir stetig die folgenden Services weiter:

  • DNA-Amplikonsequenzierung
  • De-novo Sequenzierung von Genomen
  • Re-sequenzierung von Genomen
  • Iso-Seq RNA Sequenzierung

Einen wichtige Stellung in der Datenaufbereitung und –Analyse nimmt die Bioinformatik ein. In L&B Genomics arbeiten erfahrene Bioinformatiker, die mit der Anwendung der gängigen Auswertepipelines vertraut sind. Auf der Hardware-Seite verfügen wir über die  notwendigen Server-Kapazitäten.

Basierend auf unserer wissenschaftlichen Expertise in der Auswertung großer omics-Datensätze unterstützen wir Sie gerne bei folgenden Analysen:

  • Qualitätskontrolle arraybasierter Daten
  • Genomweite Assoziationsstudien
  • Imputation
  • Analyse von DNA-Methylierung

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