Mikrobiom

Von der schnellen Identifizierung mittels 16S/18S/ITS-Amplicon-Sequenzierung bis hin zur Genom-Assemblierung und informativen Metatranskriptomanalyse – auf unsere präzisen und zuverlässigen Mikrobiomanalyse-Services können Sie sich verlassen.

Unsere Dienstleistungen:

DNA-Extraktion

Wir bieten Ihnen eine zuverlässige DNA-Extraktion aus unterschiedlichen Probenmatrices, einschließlich Proben mit einer geringen Biomasse.

Zielgerichtete Short-Read-Sequenzierung (16S, 18S, ITS)

Kosteneffiziente Lösung für metagenomische Analysen
Auswahl zwischen etablierten Primern (z. B. 16S V3V4, ITS2) oder individuellen Primern.
Bearbeitung von bis zu 384 Proben gleichzeitig

Zielgerichtete Long-Read-Sequenzierung (16S, 18S, ITS)

Maximale Informationsgewinnung durch Sequenzierung der gesamten SSU-Gens
Reduktion des Bias durch Nutzung der ONT Plattform
Bis zu 96 Proben parallel analysierbar

Metagenomische Shotgun-Sequenzierung (Illumina)

Kosteneffizientes WGS mittels NovaSeq-Plattform von Illumina
Von flacher bis ultra-tiefer Sequenzierung zur Detektion seltener Arten
Bearbeitung von bis zu 384 Proben gleichzeitig

Vollständige Mikrobiom-Genom-Sequenzierung (ONT)

Erzeugung geschlossener MAGs mit optimierten ONT-Metagenom-Tools.
Bis zu doppelt so viele HQ MAG im Vergleich zu anderen Plattformen
Hohe Präzision bei Einzel-Reads für Mutationsverfolgung und AMR-Genanalyse
Detektion modifizierter Basen (z. B. methylierte Nukleotide) für Methylierungsanalysen

Metatranskriptomik

Analyse der aktiven Genexpression innerhalb eines Mikrobiom
Analyse der mikrobiellen Aktivität aufgrund von Umweltveränderungen oder anderen Bedingungen

Datenanalyse

Unsere Mikrobiom-Experten stehen Ihnen gerne zur Verfügung. Sie unterstützen Sie zuverlässig während des gesamten bioinformatischen Analyseprozesses.